Антивирус ругается на файл .htaccess из-за того, что в нем перечислены домены, доступ с которых на сайт будет запрещен. Эти домены в черном списке у всех хостеров, поэтому этот файл .htaccess нужно сразу вносить в исключения антивируса.
Еще: вот здесь я выложил трекер iMobiTrax v.3.4, он посвежее того, что в этом мануале, плюс проверенный мной на нескольких хостингах, работает как часики. Только учите английский.
